Lección 11. Nucleótidos

Estructura Propiedades de las bases Polinucleótidos Para saber más: Chemistry of nucleic acids Introduction to nucleic acids Estructura. Los nucleótidos constan de una pentosa (ribosa en RNA y desoxirribosa en DNA), una base ((púrica (A, G) o pirimidínica (T,C en DNA y U,C en RNA)) y de 1 a 3 fosfatos. La unión de pentosa y base (sin fosfato) se denomina nucleósido. Los nucleósidos y nucleótidos toman nombres derivados de los de la base que… Seguir leyendo Lección 11. Nucleótidos

Lección 12. Estructura y estabilidad de DNA y RNA

La doble hélice: B-DNA Otras formas de doble hélice: A-DNA y Z-DNA Estructuras infrecuentes del DNA El RNA de transferencia Estabilidad de la doble hélice Desnaturalización térmica de la doble hélice Para saber más: Genetic education materials Basics of nucleic acid structure Life story The doble helix The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1962 to Francis HC Crick, James D… Seguir leyendo Lección 12. Estructura y estabilidad de DNA y RNA

Lección 13. Interacciones proteína:proteína

Naturaleza de las superficies de interacción Interacciones que se establecen Ejemplo 1: complejo enzima-inhibidor proteico Ejemplo 2: complejo anticuerpo-proteína Ejemplo 3: proteínas oligoméricas Para saber más: Wiki/Protein-Protein interactions (PPIs) Naturaleza de las superficies de interacción. En promedio, la superficie accesible al disolvente de las proteínas globulares, solubles, contiene un 55 % de área no polar,… Seguir leyendo Lección 13. Interacciones proteína:proteína

Lección 14. Interacciones proteína:ácidos nucleicos

Naturaleza de las superficies de interacción Interacciones que se establecen Motivos proteicos que rellenan el surco mayor del B-DNA Unión al surco menor con deformación del B-DNA Ejemplos: enzimas que sintetizan o modifican DNA Naturaleza de las superficies de interaccion. Las superficies de interacción de las proteínas son, en general, variadas. Desde el punto de… Seguir leyendo Lección 14. Interacciones proteína:ácidos nucleicos

Lección 15. Interacciones proteína:lípidos y proteína:glúcidos

Naturaleza de las superficies de interacción Interacciones que se establecen Ejemplo 1: recoverina Ejemplo 2: lipoproteínas  Ejemplo 3. Proteínas de membrana Ejemplo 4:  Proteína quimioreceptora de galactosa Ejemplo 5: Lectinas Para saber más: Wiky/Lipoprotein Wiki/Lectin Naturaleza de las superficies de interaccion. Las superficies de las proteínas son variadas. Las superficies de los lípidos son fundamentalmente… Seguir leyendo Lección 15. Interacciones proteína:lípidos y proteína:glúcidos

Lección 16. El ribosoma

La síntesis de proteínas. Los ribosomas procariota y eucariota. La interacción con mRNA y con tRNA El centro catalítico El ribosoma como diana terapéutica Para saber más: Nobel Prize in Chemistry 2009 Ramakrishnan-lecture-slides Ribosome Protein synthesis The Nobel Prize in Chemistry 2009 to Venkatraman Ramakrishnan, Thomas A. Steitz and Ada E. Yonath «For studies of… Seguir leyendo Lección 16. El ribosoma

Lección 17. Difracción de Rayos X

Los rayos X La difracción de rayos X por un cristal Los cristales de proteínas La toma de datos El mapa de densidad electrónica de la proteína Ajuste de la secuencia de aminoácidos al mapa Refinamiento Para saber más: Juan. Crystallography Working Page X-Ray_Crystallography Phase_problem_suits The Nobel Prize in Chemistry 1962 Max Ferdinand Perutz and John Cowdery Kendrew… Seguir leyendo Lección 17. Difracción de Rayos X

Lección 18. Resonancia magnética nuclear

El spín nuclear y la resonancia magnética nuclear El desplazamiento químico RMN monodimensional Acoplamiento de espines El efecto Overhauser nuclear (NOE) RMN bidimensional; espectros COSY de los aminoácidos Asignación de los sistemas de spin El espectros NOESY; asignación de la secuencia Los NOEs no secuenciales; calculo de estructuras compatibles Marcación con 13C y con 15N; RMN multidimensional RMN versus Rayos X. Para saber más:… Seguir leyendo Lección 18. Resonancia magnética nuclear

Lección 19. Microscopía electrónica

Microscopía electrónica El microscopio electrónico Preparación de muestras Reconstrucción de imagen Para saber más: Wiki/Cryo-electron_microscopy Cryo-em-course.caltech.edu/videos Cryo-electron-microscopy-primer-on-sample-preparation 5K12: Cryo-EM structure of glutamate dehydrogenase at 1.8 A resolution The Nobel Prize in Chemistry 1982 Aaron KlugAaron Klug «For his development of crystallographic electron microscopy and his structural elucidation of biologically important nucleic acid-protein complexes» Microscopía electrónica. La microscopía electrónica resulta ideal para obtener… Seguir leyendo Lección 19. Microscopía electrónica

Lección 20. Secuenciación de proteínas y DNA

Secuenciación de péptidos. Secuenciación de proteínas por el método de Sanger. Secuenciación de péptidos y proteínas mediante espectrometría de masas. Secuenciación de ADN por el método de Sanger. Secuenciación de ADN de segunda generación. Servicios de secuenciación de ADN. Para saber más: Sanger method of DNA sequencing Enzimas de restricción DNA Sequencing, Sanger and Next-Generation Sequencing The Nobel Prize in Chemistry 1958… Seguir leyendo Lección 20. Secuenciación de proteínas y DNA