ESTRUCTURA DE MACROMOLÉCULAS 2023-24
Grado de Biotecnología
Objetivos
- Conocer la estructura de los principales polímeros biológicos y relacionarla con las propiedades de sus monómeros y con las interacciones que establecen entre sí y con las moléculas de disolvente.
- Entender la relación entre la estructura de las macromoléculas y sus funciones biológicas.
- Comprender la importancia biotecnológica de las proteínas, ácidos nucleicos y polisacáridos.
Evaluación
Teoría.(70%) Examen al final del cuatrimestre en la fecha que la Facultad determine.
Prácticas.(30%) Examen Práctico tras su realización.
Además de la modalidad ordinaria de evaluación descrita, los alumnos que no superen el examen de prácticas deberán realizar una prueba global consistente en la realización del Examen de Teoría en la misma fecha y horario que el resto de sus compañeros y una prueba adicional de prácticas.
Bibliografía general
Estructura de Proteínas. Gómez-Moreno & Sancho eds. Ariel (2003)
Proteins: Structure and Function. D. Whitford, Wiley (2005)
Textbook of Structural Biology. Anders Liljas. World Scientific (2009)
Introduction to proteins. Kessel and Ben-Tal. CRC Press (2011)
Exploring Protein Structure: Principles and Practice. T. Skern. Springer (2018)
Nucleic Acids in Chemistry and Biology. Blackburn et al RSC Publishing (2006)
Understanding DNA. 3nd Ed. Calladine & Drew, Academic Press (2003)
Teoría
Los disolventes biológicos
Estructura y estabilidad de las proteínas
Polisacáridos
Estructura y estabilidad de los ácidos nucleicos
Interacciones entre macromoléculas. Ensamblados macromoleculares
Determinación de estructuras
Herramientas de síntesis y secuenciación
Prácticas
- Obtención de coordenadas de macromoléculas del PDB y visualización de su estructura tridimensional.
- Resolución estructural de una proteína mediante cristalografía de rayos X: cristalización y refinamiento.
- Medida de la estabilidad conformacional de una proteína mediante desnaturalización química.
- Acaba de secuenciar un gen: ¿y ahora qué?
- EXAMEN
Trabajos voluntarios
A juicio del profesor, podrá realizarse un programa de seminarios preparados e impartidos por alumnos, que será voluntario y estará moderado por el profesor, quien evaluará el rigor, la claridad y la amenidad de la exposición y podrá, en base a ello, incrementar la nota final de los alumnos participantes en hasta un 10 % de su nota previa obtenida al combinar las notas de teoría y prácticas. El contenido expuesto en tales seminarios formará parte del contenido ordinario de la materia de cara a su evaluación en el examen de teoría común a todos los alumnos.
Trabajos para el curso 2022-2023
Descubrimiento de fármacos
A novel small molecule inhibits α-synuclein aggregation, disrupts amyloid fibrils and prevents degeneration of dopaminergic neurons
Selective targeting of human and animal pathogens of the Helicobacter genus by flavodoxin inhibitors: efficacy, synergy, resistance, and mechanistic studies
Design of Pharmacological Chaperones with higher
Affinity for Phenylalanine Hydroxylase
Ingeniería y estabilidad de proteínas
Rational stabilization of complex proteins: a divide and combine approach
Direct examination of the relevance for folding, binding and electron transfer of a conserved protein folding intermediate
Unravelling the complex denaturant- and thermal-induced unfolding equilibria of human phenylalanine hydroxylase
Bioinformática y biocomputación
Molecular Dynamics Simulations for Genetic Interpretation in Protein Coding Regions: Where we Are, Where to Go and When
PirePred: An Accurate Online Consensus Tool to Interpret Newborn Screening Related Genetic Variants in Structural Context
Protposer: the web server that readily proposes protein stabilizing mutations with high PPV
A look at the face of the molten globule: Structural model of the Helicobacter pylori apoflavodoxin ensemble at acidic pH
Solicitud de Participación
Instrucciones para elaborar el resumen
Programa de seminarios 2022